RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A15Q9Y619 301 aa16.62■□□□□ 0.25
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ODC1-201ENST00000234111 Q8TAT8 98 aa16.61■□□□□ 0.25
ODC1-201ENST00000234111 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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ODC1-201ENST00000234111 IL4P05112 153 aa16.6■□□□□ 0.25
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ODC1-201ENST00000234111 Q8N8P6 123 aa16.56■□□□□ 0.24
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ODC1-201ENST00000234111 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.56■□□□□ 0.24
ODC1-201ENST00000234111 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.56■□□□□ 0.24
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ODC1-201ENST00000234111 PLNP26678 52 aa16.53■□□□□ 0.24
ODC1-201ENST00000234111 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
ODC1-201ENST00000234111 TEN1Q86WV5 123 aa16.53■□□□□ 0.24
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ODC1-201ENST00000234111 LINC01619G3V211 115 aa16.52■□□□□ 0.24
ODC1-201ENST00000234111 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
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ODC1-201ENST00000234111 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
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ODC1-201ENST00000234111 LAGE3Q14657 143 aa16.51■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 FBXL15Q9H469 300 aa16.51■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.51■□□□□ 0.23
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ODC1-201ENST00000234111 CD40P25942 277 aa16.5■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 TEX29Q8N6K0 151 aa16.5■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.5■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.49■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 F8VRH5 84 aa16.49■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 HLA-DMBP28068 263 aa16.49■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 TMEM78Q5T7P6 136 aa16.49■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.49■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 TGFAP01135 160 aa16.48■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 ZNF688P0C7X2 276 aa16.48■□□□□ 0.23
ODC1-201ENST00000234111 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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