RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 H3BRN7 92 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CDSNQ15517 529 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CT83Q5H943 113 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 OVOL3O00110 214 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 NBR2O15453 112 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CRYGBP07316 175 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 RBPJQ06330 500 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC00311Q8N616 119 aa13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 IL17RELQ6ZVW7 336 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 HBDP02042 147 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 ASCL5Q7RTU5 278 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 SPCS1Q9Y6A9 102 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CSMD2Q7Z408 3487 aa13.55□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 TRGV3P03979 118 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 FXYD2P54710 66 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 G3V318 75 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 NDUFA3O95167 84 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 PRR25Q96S07 402 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 HIF1ANQ9NWT6 349 aa13.54□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC01548A6NM66 108 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 INS-IGF2F8WCM5 200 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 EFNA4P52798 201 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 FOXC1Q12948 553 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 AMTNQ6UX39 209 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 Q8NA96 180 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CCL21O00585 134 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CEACAM4O75871 244 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 MFAP4P55083 255 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 GLMPQ8WWB7 406 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 DPM3Q9P2X0 92 aa13.53□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM158Q8WZ71 300 aa13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CLEC3BP05452 202 aa13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 FGF6P10767 208 aa13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.52□□□□□ -0.24
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV40A0A0B4J280 105 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 K7ERU9 68 aa13.52□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 ARPC1AQ92747 370 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 POLQO75417 2590 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 IGF1P05019 195 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 EMP1P54849 157 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 PLP1P60201 277 aa13.51□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM219Q86XT9 240 aa13.5□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.5□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 A6NDN8 102 aa13.5□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 CFHR4Q92496 578 aa13.5□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.5□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 C15orf32Q32M92 178 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 TNFRSF6BO95407 300 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 SMIM12Q96EX1 92 aa13.49□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 M0R381 172 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 TGFAP01135 160 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 SRD5A1P18405 259 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP1LC3AQ9H492 121 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf118A6NHY6 69 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 S100A7AQ86SG5 101 aa13.48□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 F8W735 103 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 CTSGP08311 255 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 KAAG1Q9UBP8 84 aa13.47□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 B9A039 149 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
KCNQ1-201ENST00000155840 H3BVH4 76 aa13.46□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 DTX2Q86UW9 622 aa13.46□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 SPANXN1Q5VSR9 72 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.45□□□□□ -0.26
KCNQ1-201ENST00000155840 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.5 ms