RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PSMB8	P28062	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ANK1	P16157	1881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072		K7ESM1	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	AVP	P01185	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	NPY	P01303	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	DAD1	P61803	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MLANA	Q16655	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	RPRML	Q8N4K4	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM168A	Q92567	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MDFI	Q99750	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	AGRN	O00468	2067 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	CRYGS	P22914	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NECAP1-222	ENST00000640072	PGP	A6NDG6	321 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	CD70	P32970	193 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	LAGE3	Q14657	143 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	NNAT	Q16517	81 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q1RN00	199 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q8N1Y9	231 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.84	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	CA6	P23280	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZR03	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZRM9	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZRU5	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MGST2	Q99735	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		H3BMM0	161 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	HBD	P02042	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	MDP1	Q86V88	176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		Q96M66	194 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	FXYD7	P58549	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	PCBD1	P61457	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TWIST1	Q15672	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		F5H697	171 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFS7	O75251	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		H7C2G1	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SCRG1	O75711	98 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHG1	P01857	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072		X6R8D5	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NECAP1-222	ENST00000640072	SS18	Q15532	418 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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