RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COX6B1P14854 86 aa18.83■□□□□ 0.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa18.82■□□□□ 0.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRBV19A0A075B6N1 114 aa18.78■□□□□ 0.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa18.78■□□□□ 0.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa18.78■□□□□ 0.6
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF125Q96EQ8 232 aa18.77■□□□□ 0.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa18.76■□□□□ 0.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C5orf56Q8N8D9 126 aa18.75■□□□□ 0.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF24Q9Y225 148 aa18.72■□□□□ 0.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LYPD1Q8N2G4 141 aa18.72■□□□□ 0.59
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSG3Q16557 428 aa18.71■□□□□ 0.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF414Q96IQ9 312 aa18.71■□□□□ 0.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C15orf32Q32M92 178 aa18.7■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MEGF9Q9H1U4 602 aa18.7■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC25A16P16260 332 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RHOGP84095 191 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIGQ13278 110 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LY6EQ16553 131 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PET117Q6UWS5 81 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM191AQ9H0A3 160 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa18.69■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AVPP01185 164 aa18.68■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTSGP08311 255 aa18.68■□□□□ 0.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF738Q8NE65 137 aa18.68■□□□□ 0.58
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