RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554102.5

SPATA7-208, Transcript of spermatogenesis associated 7, human

TSL 3

Gene SPATA7, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA7-208	ENST00000554102	SLC17A3	O00476	420 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102		U3KQK5	164 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPATA7-208	ENST00000554102	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SPRY2	O43597	315 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ICAM4	Q14773	271 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	NDUFB4	O95168	129 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	GCHFR	P30047	84 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	TSPO	P30536	169 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102		Q9H3A6	140 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	AGRN	O00468	2067 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102		F6UB75	175 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	TMED6	Q8WW62	240 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	RNF183	Q96D59	192 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102		K7EQM0	130 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	PPT1	P50897	306 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	CD300C	Q08708	224 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	PGP	A6NDG6	321 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102		A8MTW9	85 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	LEP	P41159	167 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102		A0A1W2PRE2	83 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102		M0R3E3	92 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	INS	P01308	110 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	HBE1	P02100	147 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SULT1A2	P50226	295 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	DEFB1	P60022	68 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF726P1	Q15940	193 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	RARRES2	Q99969	163 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	CDKN1B	P46527	198 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	RETN	Q9HD89	108 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPATA7-208	ENST00000554102	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102		F6UZH7	168 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	FXYD7	P58549	80 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	SSX7	Q7RTT5	188 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	NMB	P08949	121 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	MIF	P14174	115 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	IL17D	Q8TAD2	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPATA7-208	ENST00000554102	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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