RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 CTF1Q16619 201 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRU-209ENST00000526080 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 J3KRW8 73 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 LEPP41159 167 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 CRYBA4P53673 196 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 ARV1Q9H2C2 271 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 PRO0255Q9UI72 69 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 LRP2P98164 4655 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 IGLC2P0DOY2 106 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 TCL1AP56279 114 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 ARL6Q9H0F7 186 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SMCO3A2RU48 225 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 KLLNB2CW77 178 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 C1QBP02746 253 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 FHL2Q14192 279 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 Q6ZSA8 131 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 S100A7AQ86SG5 101 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SYT8Q8NBV8 401 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 VGLL1Q99990 258 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 RNF24Q9Y225 148 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 C7orf71A4D174 169 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 H3BTX0 84 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 CTDSP2O14595 271 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 EVI2AP22794 236 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 MORN5Q5VZ52 161 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 Q8N814 137 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 FNDC10F2Z333 226 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 H3BQ15 152 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 K7EQD1 137 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRU-209ENST00000526080 CCNKO75909 580 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 IGHV3-53P01767 116 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 SLAQ13239 276 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 C8orf49Q96NF6 230 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 MCUBQ9NWR8 336 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 TNXBP22105 4242 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 RGS5O15539 181 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 CRYGDP07320 174 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 ID3Q02535 119 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 CD300CQ08708 224 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 BTN1A1Q13410 526 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 IL18Q14116 193 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRU-209ENST00000526080 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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PTPRU-209ENST00000526080 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 OPCMLQ14982 345 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 SFT2D2O95562 160 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 HOXB5P09067 269 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 CRISP2P16562 243 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 VAMP1P23763 118 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 SRIP30626 198 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 PPP1R1AQ13522 171 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF546Q86UE3 836 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 PSENENQ9NZ42 101 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF253O75346 499 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 OR4E1P0C645 316 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 ERCC8Q13216 396 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 GUK1Q16774 197 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRU-209ENST00000526080 PRR9Q5T870 116 aa9.19□□□□□ -0.94
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