RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EM74 188 aa13.34□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF815PA8K554 130 aa13.34□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFB8O95169 186 aa13.34□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKCP01834 107 aa13.34□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.31□□□□□ -0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.31□□□□□ -0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.31□□□□□ -0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.31□□□□□ -0.28
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.31□□□□□ -0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR5A1Q8NGJ0 315 aa13.3□□□□□ -0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASL11AQ6T310 242 aa13.3□□□□□ -0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.29□□□□□ -0.28
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.26□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C10orf142B7Z368 130 aa13.26□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EREGO14944 169 aa13.26□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPC2P61916 151 aa13.26□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WISP2O76076 250 aa13.25□□□□□ -0.29
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JMJD1CQ15652 2540 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF223E7ERA6 249 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-39P01824 125 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSD52Q0P140 79 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSC4DQ8WTU2 575 aa13.25□□□□□ -0.29
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSTL1Q9H114 145 aa13.25□□□□□ -0.29
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