RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479566.5

PRKCZ-216, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-216	ENST00000479566	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		12.05	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	MUC4	Q99102	2169 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566		A8MTW9	85 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	PSG3	Q16557	428 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	GUK1	Q16774	197 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q5BKY6	102 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		12.04	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566		A0A1B0GVY2	172 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566		H3BQ15	152 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	SLC17A3	O00476	420 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	PSG9	Q00887	426 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.03	□□□□□ -0.48
PRKCZ-216	ENST00000479566	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566		H3BTX0	84 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566		M0R2N4	97 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF253	O75346	499 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF266	Q14584	549 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.02	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	RTL8C	O15255	209 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	AMTN	Q6UX39	209 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FUT9	Q9Y231	359 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	RYR1	P21817	5038 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PYY	P10082	97 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PDE6H	Q13956	83 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		12	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566		G3V3Q6	166 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	HTN3	P15516	51 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	HBE1	P02100	147 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	RHOB	P62745	196 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	NDUFB4	O95168	129 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566		M0R2Z0	102 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR7C2	O60412	319 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	M6PR	P20645	277 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	TAS2R45	P59539	299 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	FXYD5	Q96DB9	178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRAC2	D3DTV9	90 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	INS	P01308	110 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR10J4	P0C629	311 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566		M0R3E3	92 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	ARPC5	O15511	151 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	RAB2A	P61019	212 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PRKCZ-216	ENST00000479566	DAD1	P61803	113 aa		11.94	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms