RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 ARV1Q9H2C2 271 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 SLC25A22Q9H936 323 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 S100A10P60903 97 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 Q8N1X5 172 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 RPRMQ9NS64 109 aa7.53□□□□□ -1.2
NISCH-206ENST00000474188 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 LYRM9A8MSI8 78 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 F5H768 121 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 H3BRN7 92 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 NUDT3O95989 172 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 UHRF2Q96PU4 802 aa7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 H3BP45 60 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ORM2P19652 201 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 HOXA5P20719 270 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TSPOP30536 169 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 RAB14P61106 215 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PATE2Q6UY27 113 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PRAC2D3DTV9 90 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 INSP01308 110 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 GALR1P47211 349 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ESRGQ1W209 222 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SSX7Q7RTT5 188 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 COMMD7Q86VX2 200 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ATG101Q9BSB4 218 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 WFDC1Q9HC57 220 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 IGSF23A1L1A6 192 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 CBY3A6NI87 242 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 WRBO00258 174 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SCGB1D2O95969 90 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 Q9H8V8 135 aa7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SYNGR2O43760 224 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 MEOX2P50222 304 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TAS2R30P59541 319 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 NHLH2Q02577 135 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 MORN5Q5VZ52 161 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SMIM8Q96KF7 97 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 LINC01587Q99440 93 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 A0A087X0K7 114 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 A0A0J9YY99 117 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 H3BTX0 84 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SSSCA1O60232 199 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ATP5G1P05496 136 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ATP5G3P48201 142 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 SULT1A2P50226 295 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TAS2R60P59551 318 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PLP1P60201 277 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 RAB11AP62491 216 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 DLK1P80370 383 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 BAXQ07812 192 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ARL16Q0P5N6 197 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 PSG3Q16557 428 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 ZNF738Q8NE65 137 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.47□□□□□ -1.21
NISCH-206ENST00000474188 TMED6Q8WW62 240 aa7.47□□□□□ -1.21
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