RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447271.1

PTPN3-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, human

TSL 2

Gene PTPN3, Length 587 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN3-205	ENST00000447271	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	CHEK1	O14757	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TOX4	O94842	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NDUFA3	O95167	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TFF1	P04155	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	CRYGB	P07316	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	COX7A1	P24310	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ARF6	P62330	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	EBI3	Q14213	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A1W2PPI3	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A1W2PS18	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HSBP1	O75506	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PLAU	P00749	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TMEM11	P17152	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NPPC	P23582	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	G0S2	P27469	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IER3	P46695	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	LYZ	P61626	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		Q56UQ5	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HSPG2	P98160	4391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		A0A0G2JLM5	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		A8MWP6	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		F2Z2F3	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		H3BUA1	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		I3L2K1	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PHOX2A	O14813	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TCRA	P04437	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SOD3	P08294	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	PSG1	P11464	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	MFAP2	P55001	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SST	P61278	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	HBB	P68871	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271		Q9H3A6	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN3-205	ENST00000447271	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms