RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442691.6

NR1I3-211, Transcript of nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NR1I3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3-211ENST00000442691 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.91□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.91□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 HIVEP1P15822 2718 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 M0R036 132 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 SLC17A3O00476 420 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 LTAP01374 205 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 UBE2G1P62253 170 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 OR5B12Q96R08 314 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.9□□□□□ -1.3
NR1I3-211ENST00000442691 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 C2orf70A6NJV1 201 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 DIRC3C9JPN6 131 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 SOCS3O14543 225 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CBLN1P23435 193 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 SYNJ2BPP57105 145 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 PSG3Q16557 428 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CENPWQ5EE01 88 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OR11H1Q8NG94 326 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ISOC2Q96AB3 205 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 BTF3L4Q96K17 158 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 C17orf77Q96MU5 243 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 IMMP2LQ96T52 175 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 DERL1Q9BUN8 251 aa6.89□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 MTORP42345 2549 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CCL24O00175 119 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 GCGP01275 180 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CD28P10747 220 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ID1P41134 155 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 PAFAH1B2P68402 229 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ADIRFQ15847 76 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 Q86TA4 180 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 BAGE2Q86Y30 109 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 RAX2Q96IS3 184 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 MLST8Q9BVC4 326 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ZFHX3Q15911 3703 aa6.88□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OVOL1O14753 267 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 FOLR2P14207 255 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CT83Q5H943 113 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 TCF24Q7RTU0 167 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OCC1Q8TAD7 63 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 SFRP2Q96HF1 295 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 C16orf92Q96LL3 132 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OSTCQ9NRP0 149 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF492Q9P255 531 aa6.87□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 H3BTX0 84 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 H7BYZ3 331 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 IGLV2-11P01706 119 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 IGLV2-8P01709 118 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 SLURP1P55000 103 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 GNG5P63218 68 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 LCN12Q6JVE5 192 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 DCANP1Q8TF63 244 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.86□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 K7EN84 100 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 K7EQG2 157 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 M0R3E3 92 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 CSN3P07498 182 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 S100PP25815 95 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 BTN1A1Q13410 526 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 DEFB136Q30KP8 78 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 RNF212Q495C1 297 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NR1I3-211ENST00000442691 LINC00477Q96M19 166 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms