RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 IGHV1-46P01743 117 aa15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 AMN1Q8IY45 258 aa15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 HCP5Q6MZN7 132 aa15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 CEND1Q8N111 149 aa15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF502Q8TBZ5 544 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 H3BRN7 92 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 PLGLAQ15195 96 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 PRORYQ9H606 182 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 DKK2Q9UBU2 259 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.15■□□□□ 0.02
MVB12A-201ENST00000317040 CRYGBP07316 175 aa15.14■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 PDE6HQ13956 83 aa15.14■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 ODF1Q14990 250 aa15.14■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 S100A7AQ86SG5 101 aa15.14■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 CACNA1BQ00975 2339 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 M0R1B8 84 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 CEACAM4O75871 244 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 ATP5LO75964 103 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 FCER1GP30273 86 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 CKS2P33552 79 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM213A2RRL7 107 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 Q71RC1 249 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TPPP3Q9BW30 176 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.13■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 IGLL5B9A064 214 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 NPYP01303 97 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 IGKCP01834 107 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF562Q6V9R5 426 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 MTURNQ8N3F0 131 aa15.12■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 LINC01619G3V211 115 aa15.11■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 CCL3L1P16619 93 aa15.11■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 Q6ZS92 163 aa15.11■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 I3L2K1 104 aa15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 SH2D1AO60880 128 aa15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF479Q96JC4 524 aa15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TMEM133Q9H2Q1 129 aa15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 DPM2O94777 84 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TWIST1Q15672 202 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TM4SF20Q53R12 229 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 C18orf15Q96N68 181 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 CNFNQ9BYD5 112 aa15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
MVB12A-201ENST00000317040 TEX22C9J3V5 150 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 GOSR1O95249 250 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 IGKV1-17P01599 117 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 IGLC6P0CF74 106 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 WFDC2Q14508 124 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 AAMDCQ9H7C9 122 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 ATRXP46100 2492 aa15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 TCTAP57738 103 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 SCGB2A2Q13296 93 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 MRAP2Q96G30 205 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 C8orf49Q96NF6 230 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 BSNQ9UPA5 3926 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1B0GWB2 263 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 K7ERJ3 54 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.07■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 DLX6P56179 175 aa15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 CKS1BP61024 79 aa15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 GAGE13Q4V321 117 aa15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 PRO0461Q9UI25 63 aa15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 SPTA1P02549 2419 aa15.06■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 RBP4P02753 201 aa15.05■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 LEPP41159 167 aa15.05■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 FXYD7P58549 80 aa15.05■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 C12orf74Q32Q52 190 aa15.05■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.05■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 ARPC1AQ92747 370 aa15.05■□□□□ 0
MVB12A-201ENST00000317040 C17orf77Q96MU5 243 aa15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms