RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 GCGP01275 180 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 TRGC1P0CF51 173 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 GP9P14770 177 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 NDUFA6P56556 154 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 FRZBQ92765 325 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 OSTCQ9NRP0 149 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 IL36BQ9NZH7 164 aa9.12□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 F8W735 103 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 ISLRO14498 428 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 ERVFC1-1P60608 527 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 SMIM12Q96EX1 92 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 EPDR1Q9UM22 224 aa9.11□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF320A2RRD8 509 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 OVOL1O14753 267 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 S100A7P31151 101 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 RANP62826 216 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 RNF125Q96EQ8 232 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.1□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 PGPA6NDG6 321 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 H3BRN7 92 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 IGLV2-8P01709 118 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 SYNJ2BPP57105 145 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 BLNKQ8WV28 456 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 OTORQ9NRC9 128 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 CTSGP08311 255 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 SMIM6P0DI80 62 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 IGLL1P15814 213 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 MEOX2P50222 304 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 ATG101Q9BSB4 218 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 V9GYV3 84 aa9.09□□□□□ -0.95
C16orf46-201ENST00000299578 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF98A6NK75 572 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 IL4P05112 153 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 ADMP35318 185 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 UBE2G1P62253 170 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 OR5I1Q13606 314 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 BAGE2Q86Y30 109 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 GPHB5Q86YW7 130 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 FMC1Q96HJ9 113 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 Q9H3A6 140 aa9.08□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 COX19Q49B96 90 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 LEMD1Q68G75 181 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 C12orf57Q99622 126 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa9.07□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 LGALS9O00182 355 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 SLC17A3O00476 420 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 TCRAP04437 139 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 S100A2P29034 98 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 REC114Q7Z4M0 266 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 GPR82Q96P67 336 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 PEMTQ9UBM1 199 aa9.06□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 A8MWP6 167 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 G3V4G9 280 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 NDUFA4O00483 81 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 SAP30O75446 220 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 IGLC2P0DOY2 106 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 LINC00479Q96M42 142 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 GNG5P63218 68 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 PDE6HQ13956 83 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.05□□□□□ -0.96
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms