RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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PTX4-201ENST00000293922 BCL2P10415 239 aa13.56□□□□□ -0.24
PTX4-201ENST00000293922 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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PTX4-201ENST00000293922 DEFB125Q8N687 156 aa13.55□□□□□ -0.24
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PTX4-201ENST00000293922 LINC00862A6NCI5 91 aa13.54□□□□□ -0.24
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PTX4-201ENST00000293922 HIST1H2BAQ96A08 127 aa13.47□□□□□ -0.25
PTX4-201ENST00000293922 C11orf52Q96A22 123 aa13.47□□□□□ -0.25
PTX4-201ENST00000293922 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
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PTX4-201ENST00000293922 DIRC3C9JPN6 131 aa13.47□□□□□ -0.25
PTX4-201ENST00000293922 F6UZH7 168 aa13.47□□□□□ -0.25
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PTX4-201ENST00000293922 DEFB131AP59861 70 aa13.47□□□□□ -0.25
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PTX4-201ENST00000293922 ATG101Q9BSB4 218 aa13.47□□□□□ -0.25
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