RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNS1Q96KK3 526 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF12Q9Y4X4 402 aa5.52□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C22orf46C9J442 243 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 E7EUB6 86 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 NBR2O15453 112 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF253O75346 499 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 FCN3O75636 299 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM40O96008 361 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MOSP00540 346 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV2-8P01709 118 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 P01737 135 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PYYP10082 97 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MFAP2P55001 183 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 LYZP61626 148 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 FXYD3Q14802 87 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MMDQ15546 238 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 BLNKQ8WV28 456 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT11Q96G61 164 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf144Q96I85 54 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TBX15Q96SF7 602 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPB9Q9BQS6 159 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 VAMP8Q9BV40 100 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 THYN1Q9P016 225 aa5.51□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GW15 77 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX22C9J3V5 150 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 LY6LH3BQJ8 138 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R143 59 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 GPX1P07203 203 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PMCHP20382 165 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SRIP30626 198 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCNOSP40205 109 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 AMTP48728 403 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MFAP4P55083 255 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TCL1AP56279 114 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 NPBQ8NG41 125 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9H3A6 140 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXL15Q9H469 300 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 GNB4Q9HAV0 340 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.5□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 I3L2K1 104 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2J3O76001 311 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFA3O95167 84 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 LTAP01374 205 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TCRAP04437 139 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLC1P0CG04 106 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PSG1P11464 419 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 GP9P14770 177 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 CSN1S1P47710 185 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 HBBP68871 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PAX8Q06710 450 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE6HQ13956 83 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 HES1Q14469 280 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PMCHL1Q16048 86 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6AWC8 147 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR27Q6MZM9 219 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6YL49 198 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZSV7 163 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.49□□□□□ -1.53
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.49□□□□□ -1.53
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