RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 CXCL8P10145 99 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 S100A11P31949 105 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 MYH11P35749 1972 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 LY6EQ16553 131 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 C3orf56Q8N813 242 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 LZICQ8WZA0 190 aa3.31□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.31□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 SLC22A1O15245 554 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 RTL8CO15255 209 aa3.3□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 HCRTO43612 131 aa3.3□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 BORCS8Q96FH0 119 aa3.3□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 PLCXD2Q0VAA5 305 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.29□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 PKMYT1Q99640 499 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.29□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 SPANXCQ9NY87 97 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ATRXP46100 2492 aa3.28□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.28□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.27□□□□□ -1.89
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MDM2-201ENST00000258148 LINC00167Q96N53 147 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 EPDR1Q9UM22 224 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.27□□□□□ -1.89
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