RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf50Q96LR7 162 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 LINC01587Q99440 93 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 FAM25EA8MYX2 175 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 PET100P0DJ07 73 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB130BP0DP73 79 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB130AP0DP74 79 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF546Q86UE3 836 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 GGACTQ9BVM4 153 aa14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 MPC2O95563 127 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.86□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.86□□□□□ -0.03
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NEDD8-201ENST00000250495 MED14OSP0DP75 135 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 AZU1P20160 251 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 S100A1P23297 94 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 TAS2R60P59551 318 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 IL15RAQ13261 267 aa14.85□□□□□ -0.03
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NEDD8-201ENST00000250495 ATG101Q9BSB4 218 aa14.85□□□□□ -0.03
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NEDD8-201ENST00000250495 NACAE9PAV3 2078 aa14.85□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 AGPAT2O15120 278 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 CDKN1BP46527 198 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 LCN15Q6UWW0 184 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 SLC51BQ86UW2 128 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.84□□□□□ -0.03
NEDD8-201ENST00000250495 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 CBY3A6NI87 242 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 F5H768 121 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 ATP5G1P05496 136 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 ATP5G3P48201 142 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 ARL16Q0P5N6 197 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 C16orf74Q96GX8 76 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 MBD2Q9UBB5 411 aa14.83□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 RNF222A6NCQ9 220 aa14.82□□□□□ -0.04
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NEDD8-201ENST00000250495 VAMP2P63027 116 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 CLLU1Q5K131 121 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 BCL2L11O43521 198 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 COX7A2P2O60397 106 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 RAB31Q13636 194 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.81□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 MGST2Q99735 147 aa14.8□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 H7BYZ3 331 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 NUDT3O95989 172 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 Q6ZRG5 221 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 AQP10Q96PS8 301 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 PKHD1P08F94 4074 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00862A6NCI5 91 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 H0YIZ8 118 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 CAMLGP49069 296 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 CCL18P55774 89 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 RAB14P61106 215 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-201ENST00000250495 RLN2P04090 185 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 RAB32Q13637 225 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 MUC4Q99102 2169 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 IGLC2P0DOY2 106 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 CAV2P51636 162 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 GUK1Q16774 197 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 PKD1P98161 4303 aa14.76□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 H3BTX0 84 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 MORN5Q5VZ52 161 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 STOML3Q8TAV4 291 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 UQCC1Q9NVA1 299 aa14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-201ENST00000250495 PRAC2D3DTV9 90 aa14.74□□□□□ -0.05
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