RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 PAX6P26367 422 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NDPQ00604 133 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 KHDC3LQ587J8 217 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MIC13Q5XKP0 118 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SPNS3Q6ZMD2 512 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 Q6ZR54 194 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 Q8N2B8 174 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR5T1Q8NG75 326 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 Q8WTZ3 238 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ACY3Q96HD9 319 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FAM210AQ96ND0 272 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MANBALQ9NQG1 85 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TMEM218A2RU14 115 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GNG7O60262 68 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 COX7A2P2O60397 106 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 HYPMO75409 117 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 YIF1AO95070 293 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CD5P06127 495 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 IGLC1P0CG04 106 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RD3LP0DJH9 198 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C8orf88P0DMB2 117 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FHITP49789 147 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RAB9AP51151 201 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SLC35B1P78383 322 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ATP5G2Q06055 141 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF726P1Q15940 193 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LY6EQ16553 131 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GUK1Q16774 197 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ECSCRQ19T08 205 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LCN15Q6UWW0 184 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PARLQ9H300 379 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 VSIRQ9H7M9 311 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FUT9Q9Y231 359 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PLCE1Q9P212 2302 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.06□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 PSMB11A5LHX3 300 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 G3V318 75 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TMEM250H0YL14 139 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 I3L521 148 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CCL24O00175 119 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 OR2J3O76001 311 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 IGKV1-17P01599 117 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 IGHG4P01861 327 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CTSGP08311 255 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 APELAP0DMC3 54 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 BCL2P10415 239 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 CD99P14209 185 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZP3P21754 424 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 GCHFRP30047 84 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 BLCAPP62952 87 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 RHOGP84095 191 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 C15orf32Q32M92 178 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 Q56UQ5 140 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LCE1CQ5T751 118 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 FAM78BQ5VT40 261 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 SEC11CQ9BY50 192 aa3.05□□□□□ -1.92
CASC19-241ENST00000641582 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms