RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	OPCML	Q14982	345 aa		12.01	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.01	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF709	Q8N972	641 aa		12.01	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.01	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.01	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMBP	P02760	352 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXCL3	P19876	107 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHOB	P62745	196 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLINT1	Q14677	625 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSG3	Q16557	428 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	HRH4	Q9H3N8	390 aa		12	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035		H0YIZ8	118 aa		11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTTG1	O95997	202 aa		11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		11.99	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	MPC2	O95563	127 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	GUK1	Q16774	197 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEU1	Q99519	415 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		11.98	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	LY6G6C	O95867	125 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	HBE1	P02100	147 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMP1	P54849	157 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	RFNG	Q9Y644	331 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.97	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BTX0	84 aa		11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.96	□□□□□ -0.49
JMJD1C-211	ENST00000633035		A8MTW9	85 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R2Z0	102 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	INS	P01308	110 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFNA5	P01569	189 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP5S	Q99766	215 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MED28	Q9H204	178 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.95	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BQ15	152 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TENM2	Q9NT68	2774 aa		11.94	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLL5	B9A064	214 aa		11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCTA	P57738	103 aa		11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q6ZTC4	211 aa		11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.93	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC17A3	O00476	420 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF253	O75346	499 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSPO	P30536	169 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDKN1B	P46527	198 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01587	Q99440	93 aa		11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
JMJD1C-211	ENST00000633035	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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