RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
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HCG18-242ENST00000602319 H3BTX0 84 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 IGLC6P0CF74 106 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CEND1Q8N111 149 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 RAB37Q96AX2 223 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GWB2 263 aa7.79□□□□□ -1.16
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HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PRF3 423 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PRM7 423 aa7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZS92 163 aa7.79□□□□□ -1.16
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HCG18-242ENST00000602319 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 RNF185Q96GF1 192 aa7.79□□□□□ -1.16
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 ATP6V0BQ99437 205 aa7.78□□□□□ -1.16
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HCG18-242ENST00000602319 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.78□□□□□ -1.16
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HCG18-242ENST00000602319 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 PRSS47A8MTI9 375 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 C16orf97H3BN30 126 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A17O43808 307 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 TDHQ8IZJ6 230 aa7.78□□□□□ -1.16
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GV72 72 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 IGLL5B9A064 214 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 K7EQM0 130 aa7.77□□□□□ -1.17
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HCG18-242ENST00000602319 IGKV1-17P01599 117 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 CCL3L1P16619 93 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 C8orf49Q96NF6 230 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 SH2D1AO60880 128 aa7.77□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 FCER1GP30273 86 aa7.77□□□□□ -1.17
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HCG18-242ENST00000602319 WFDC2Q14508 124 aa7.74□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.74□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.74□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 J3QR89 54 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 CKS2P33552 79 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 FXYD7P58549 80 aa7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HCG18-242ENST00000602319 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.73□□□□□ -1.17
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