RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600155.1

LINC00649-211, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 1,108 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-211ENST00000600155 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TRIM63Q969Q1 353 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 C17orf77Q96MU5 243 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 NUDT3O95989 172 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 LINC00869P0C866 280 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 M6PRP20645 277 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 S100A5P33763 92 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 FGL1Q08830 312 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TEPPQ6URK8 271 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF546Q86UE3 836 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 MCFD2Q8NI22 146 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 SMIM8Q96KF7 97 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ODF3Q96PU9 254 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TSC22D2O75157 780 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 OR5G3P0C626 314 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PPP1R1AQ13522 171 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 GUK1Q16774 197 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 BAP18Q8IXM2 172 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 C18orf15Q96N68 181 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ARV1Q9H2C2 271 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 Q9H3A6 140 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 Q9H8V8 135 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PSENENQ9NZ42 101 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 SMCO3A2RU48 225 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 HOXB5P09067 269 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TNP2Q05952 138 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PYDC2Q56P42 97 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 SSX7Q7RTT5 188 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 Q8N1X5 172 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RNF182Q8N6D2 247 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RNF141Q8WVD5 230 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 C9orf170A2RU37 121 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 SNURFLB1AK76 121 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 K7EP13 123 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 GOSR2O14653 212 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RLN2P04090 185 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 RAB31Q13636 194 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 ARL6Q9H0F7 186 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00649-211ENST00000600155 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 H3BMQ9 156 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 H3BP45 60 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF253O75346 499 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 AZU1P20160 251 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 LEPP41159 167 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 Q6ZRG5 221 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 V9GYH0 126 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 CENPXA8MT69 81 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 NDUFB6O95139 128 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 INPP1P49441 399 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 SLAQ13239 276 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 OR5I1Q13606 314 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 PFDN5Q99471 154 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 EREGO14944 169 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 SSSCA1O60232 199 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 COX7A2P2O60397 106 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 NMBP08949 121 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 HTN1P15515 57 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 UHRF2Q96PU4 802 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 PRELID1Q9Y255 219 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00649-211ENST00000600155 HSPG2P98160 4391 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms