RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 PEMTQ9UBM1 199 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SMPXQ9UHP9 88 aa6.69□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 A0A1W2PRX2 142 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TMEM213A2RRL7 107 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TMEM218A2RU14 115 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 HELTA6NFD8 242 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 C9JQL5 133 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TMEM250H0YL14 139 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 H3BQ15 152 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 M0QZ24 198 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CCL24O00175 119 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 ZNF253O75346 499 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 S100A1P23297 94 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 ATP5G3P48201 142 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SLURP1P55000 103 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CD81P60033 236 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TM4SF20Q53R12 229 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 AWAT1Q58HT5 328 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 BLNKQ8WV28 456 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 RAX2Q96IS3 184 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.68□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 C2orf70A6NJV1 201 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 ZNF785A8K8V0 405 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 GGTLC3B5MD39 225 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CHEK1O14757 476 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SFTA3P0C7M3 94 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 MYCNOSP40205 109 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP10-3P60369 221 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 PSG9Q00887 426 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 C11orf52Q96A22 123 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 OTORQ9NRC9 128 aa6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.67□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 33.4
CLTC-212ENST00000580081 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 NDUFB4O95168 129 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CBLN1P23435 193 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 RANP62826 216 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 DUX3Q96PT4 197 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SEC11CQ9BY50 192 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 Q9H3A6 140 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 JMJD1CQ15652 2540 aa6.66□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CUBNO60494 3623 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 PGPA6NDG6 321 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 F8W036 122 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 H3BTX0 84 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SLC17A3O00476 420 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 FOLR2P14207 255 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 TCF24Q7RTU0 167 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 C17orf77Q96MU5 243 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 LINC00052Q96N35 136 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CITED1Q99966 193 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 PRELID1Q9Y255 219 aa6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLTC-212ENST00000580081 PEX7O00628 323 aa6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 OVOL1O14753 267 aa6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 CSN3P07498 182 aa6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 ADCYAP1P18509 176 aa6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 CEBPGP53567 150 aa6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLTC-212ENST00000580081 ATG101Q9BSB4 218 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms