RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-208ENST00000579358 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.35□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 C20orf173Q96LM9 149 aa7.35□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.35□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 FUT9Q9Y231 359 aa7.35□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 A8MTW9 85 aa7.34□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 C4BPBP20851 252 aa7.34□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 PDE6HQ13956 83 aa7.34□□□□□ -1.23
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MKS1-208ENST00000579358 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.34□□□□□ -1.23
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MKS1-208ENST00000579358 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.34□□□□□ -1.23
MKS1-208ENST00000579358 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.34□□□□□ -1.23
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MKS1-208ENST00000579358 TAS2R45P59539 299 aa7.33□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 PYYP10082 97 aa7.32□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 SERF2P84101 59 aa7.32□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 ZNF345Q14585 488 aa7.32□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.32□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.32□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 RARRES2Q99969 163 aa7.32□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 OR51M1Q9H341 326 aa7.32□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 OR11H2Q8NH07 326 aa7.31□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 MUC7Q8TAX7 377 aa7.31□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 PAXXQ9BUH6 204 aa7.31□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 A0A1W2PPV4 95 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 C3orf84H3BNL1 204 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 OR7C2O60412 319 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 NDUFB4O95168 129 aa7.3□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 RAB2AP61019 212 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.3□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 IL17DQ8TAD2 202 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 RNF141Q8WVD5 230 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 FXYD5Q96DB9 178 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 ZNF503Q96F45 646 aa7.3□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 XCL2Q9UBD3 114 aa7.3□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 RFNGQ9Y644 331 aa7.3□□□□□ -1.24
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MKS1-208ENST00000579358 A0A0D9SG52 128 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 A0A0J9YWU9 116 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 OR10J4P0C629 311 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 MIFP14174 115 aa7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MKS1-208ENST00000579358 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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