RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 GLIPR2Q9H4G4 154 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 PSENENQ9NZ42 101 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 TAAR2Q9P1P5 351 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.59□□□□□ -1.83
C15orf40-210ENST00000563387 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.59□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.59□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LRRK2Q5S007 2527 aa3.59□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ITPR2Q14571 2701 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SPG11Q96JI7 2443 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 KNCNA6PVL3 124 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM150CB9EJG8 249 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TIMM23O14925 209 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SLC25A20O43772 301 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SPINK4O60575 86 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NXPH3O95157 252 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CLDN14O95500 239 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CXCL8P10145 99 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 MFAP2P55001 183 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 HERVK_113P61574 105 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FAM27E3Q08E93 113 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TWIST1Q15672 202 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LPAL2Q16609 132 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FAM201AQ5SY85 155 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PFN4Q8NHR9 129 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 IL17DQ8TAD2 202 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 S1PR3Q99500 378 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FOXC2Q99958 501 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 EMC6Q9BV81 110 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 USP17L23D6RBM5 183 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LMO7DNF2Z398 122 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 C5orf67F2Z3F1 127 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LIFP15018 202 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FCER1GP30273 86 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 LRBAP50851 2863 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 FXYD4P59646 89 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PCBD1P61457 104 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CACNG7P62955 275 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF56Q15929 161 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 SP6Q3SY56 376 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CENPWQ5EE01 88 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 Q6ZQT7 251 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 Q6ZSR3 168 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PIANPQ8IYJ0 282 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 Q96MF0 132 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 CCDC140Q96MF4 163 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ODF3Q96PU9 254 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 DSCR8Q96T75 97 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 VKORC1Q9BQB6 163 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PDFQ9HBH1 243 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 R4GMQ9 66 aa3.57□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 PTPRDP23468 1912 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.56□□□□□ -1.84
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV17A0A0B4J275 112 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms