RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01549A6NIU2 74 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 CRYGBP07316 175 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 RNF182Q8N6D2 247 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 PPYP01298 95 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 TEX45Q8NA69 505 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 LINC00479Q96M42 142 aa5.15□□□□□ -1.58
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PTPRB-210ENST00000551525 OSTCQ9NRP0 149 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-210ENST00000551525 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 PRR13Q9NZ81 148 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 OVOL1O14753 267 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 SFTA2Q6UW10 78 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf51C9J302 202 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 NPYP01303 97 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 C16orf92Q96LL3 132 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 NBR2O15453 112 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 PLXNA3P51805 1871 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF146Q15072 292 aa5.14□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 C1QL2Q7Z5L3 287 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 YPEL1O60688 119 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-46P01743 117 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 NTF4P34130 210 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 C12orf74Q32Q52 190 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 C4orf26Q17RF5 130 aa5.13□□□□□ -1.59
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PTPRB-210ENST00000551525 VOPP1Q96AW1 172 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 USMG5Q96IX5 58 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 CX3CL1P78423 397 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 GGNQ86UU5 652 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF815PA8K554 130 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 F5H697 171 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM178BH3BS89 294 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFS5O43920 106 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 AMTNQ6UX39 209 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 RNF152Q8N8N0 203 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 Q8TCH9 128 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 ATRXP46100 2492 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-210ENST00000551525 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.12□□□□□ -1.59
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