RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530334.5

ACER3-208, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2

Gene ACER3, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-208	ENST00000530334	C4BPB	P20851	252 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	NPY1R	P25929	384 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	BTC	P35070	178 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334		Q6ZVQ6	151 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	STH	Q8IWL8	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334		A0A087X002	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CHEK1	O14757	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TMEM50A	O95807	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CFC1	P0CG37	223 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	IAPP	P10997	89 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	MIF	P14174	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	S100G	P29377	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	DEFB1	P60022	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	RNF212	Q495C1	297 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	RBKS	Q9H477	322 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.17	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	NDUFA4	O00483	81 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	PLA2G10	O15496	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	GNG7	O60262	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	ADAP1	O75689	374 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CCNK	O75909	580 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	SNCA	P37840	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	OPRK1	P41145	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	RND2	P52198	227 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	GAMT	Q14353	236 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	LEMD1	Q68G75	181 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334		Q8NAQ8	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	FRZB	Q92765	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	PRRT1	Q99946	306 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	THYN1	Q9P016	225 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ACER3-208	ENST00000530334	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334		A0A087WYN8	130 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334		H3BP45	60 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	PITX3	O75364	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	SFT2D2	O95562	160 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	SPCS3	P61009	180 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	DHODH	Q02127	395 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334		Q6ZRP5	223 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334		A0A0B4J2A0	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ACER3-208	ENST00000530334	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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