RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 S100A7P31151 101 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 BAP18Q8IXM2 172 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 LRTM2Q8N967 370 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01587Q99440 93 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 CLINT1Q14677 625 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 RNF182Q8N6D2 247 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 RNF141Q8WVD5 230 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TAS2R60P59551 318 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 FGL1Q08830 312 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 SSX7Q7RTT5 188 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 MITD1Q8WV92 249 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 Q9H8V8 135 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 PRSS46E5RG02 174 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 MED6O75586 246 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 RHOBP62745 196 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF738Q8NE65 137 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 SLC25A6P12236 298 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 HTN1P15515 57 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 C16orf74Q96GX8 76 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 HERC1Q15751 4861 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRU-210ENST00000527027 C7orf66A4D0T2 115 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 H3BRN7 92 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 SYNGR2O43760 224 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 WRBO00258 174 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 SSNA1O43805 119 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 CXCL3P19876 107 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 AKR1C1Q04828 323 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 TTC32Q5I0X7 151 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 KRTAP10-2P60368 255 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 RAP2BP61225 183 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 OR5I1Q13606 314 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 PSG3Q16557 428 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF503Q96F45 646 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 UHRF2Q96PU4 802 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 Q9H3A6 140 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PPQ1 181 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 HYPMO75409 117 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 M6PRP20645 277 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 CDKN1BP46527 198 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 ALG5Q9Y673 324 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 A0A087X0K7 114 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 H7BYZ3 331 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 HOXB5P09067 269 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 ASB13Q8WXK3 278 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 UPK3BQ9BT76 320 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 MED28Q9H204 178 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 H3BP45 60 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 ADAP1O75689 374 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 OR5G3P0C626 314 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 PLP1P60201 277 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 ESRGQ1W209 222 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 Q6ZNX1 250 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 S100A7AQ86SG5 101 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRU-210ENST00000527027 A0A0J9YY99 117 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 SMCO3A2RU48 225 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 C5orf51A6NDU8 294 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRU-210ENST00000527027 H3BNG1 76 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms