RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515707.1

ABCC3-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ABCC3, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 CXCL2P19875 107 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 FGF7P21781 194 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 MORN5Q5VZ52 161 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 Q6ZRG5 221 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF738Q8NE65 137 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCC3-217ENST00000515707 CXCL3P19876 107 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 B2MP61769 119 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 LCN15Q6UWW0 184 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 AMTNQ6UX39 209 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 PFDN5Q99471 154 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 H0YIZ8 118 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 NHLH2Q02577 135 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 NEU1Q99519 415 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 PET100P0DJ07 73 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 HLA-DMBP28068 263 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 PTTG1O95997 202 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 IGLC2P0DOY2 106 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 PSG3Q16557 428 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 THAP6Q8TBB0 222 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 SLC17A3O00476 420 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 AMBPP02760 352 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 CLINT1Q14677 625 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 CELA1Q9UNI1 258 aa14.54□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 C11orf94C9JXX5 98 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 MPC2O95563 127 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 RFNGQ9Y644 331 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCC3-217ENST00000515707 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM189A5PLL7 270 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 H3BQ15 152 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 M0R2Z0 102 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 INSP01308 110 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 GUK1Q16774 197 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 Q6ZTC4 211 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 RNF126Q9BV68 326 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 ALG5Q9Y673 324 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 H3BTX0 84 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 LY6G6CO95867 125 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 HBE1P02100 147 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 BAP18Q8IXM2 172 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 ATP5SQ99766 215 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 MBD2Q9UBB5 411 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 HSPB11Q9Y547 144 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TRAV10A0A0B4J240 114 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 RHOBP62745 196 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF253O75346 499 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 EMP1P54849 157 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TCTAP57738 103 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 RRN3P1Q2M238 152 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 C12orf74Q32Q52 190 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.48□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.47□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.46□□□□□ -0.09
ABCC3-217ENST00000515707 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms