RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514834.1

ITGA3-214, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-214ENST00000514834 C1orf194Q5T5A4 169 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 FGF7P21781 194 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 SULT1A2P50226 295 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 Q6ZRG5 221 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 IL17DQ8TAD2 202 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 ARV1Q9H2C2 271 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 WDR83OSQ9Y284 106 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 AGPAT2O15120 278 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 SPP1P10451 314 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 CAMLGP49069 296 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 SUN5Q8TC36 379 aa10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-214ENST00000514834 HYDINQ4G0P3 5121 aa10.15□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 CA1P00915 261 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00869P0C866 280 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ORM2P19652 201 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PMS2P11Q13670 270 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 LINC00052Q96N35 136 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 MGST2Q99735 147 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 NRN1Q9NPD7 142 aa10.14□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ZNF98A6NK75 572 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 HYPMO75409 117 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 DEFB1P60022 68 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PSMG4Q5JS54 123 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ACTL10Q5JWF8 245 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 OR1L4Q8NGR5 311 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 OR1B1Q8NGR6 318 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PFDN5Q99471 154 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 H3BRN7 92 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 DEFB4AO15263 64 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ATP6V0CP27449 155 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PRR20EP86478 221 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PRR20CP86479 221 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PRR20DP86480 221 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PRR20BP86481 221 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PRR20AP86496 221 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PATE2Q6UY27 113 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 STHQ8IWL8 128 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 OR11H2Q8NH07 326 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 RARRES2Q99969 163 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 A0A1W2PPV4 95 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 CXorf65A6NEN9 183 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 HBE1P02100 147 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 C17orf77Q96MU5 243 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 GPR82Q96P67 336 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 WFDC1Q9HC57 220 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TREM1Q9NP99 234 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 DOK5Q9P104 306 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 OR5G3P0C626 314 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TAS2R45P59539 299 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 B2MP61769 119 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SCRT1Q9BWW7 348 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 HRH4Q9H3N8 390 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.1□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM218A2RU14 115 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SOCS3O14543 225 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 APOC3P02656 99 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 GALR1P47211 349 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 RHOBP62745 196 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 FFAR4Q5NUL3 377 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SVBPQ8N300 66 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 UHRF2Q96PU4 802 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 SLC25A22Q9H936 323 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.09□□□□□ -0.79
ITGA3-214ENST00000514834 COX7A2P2O60397 106 aa10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-214ENST00000514834 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-214ENST00000514834 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-214ENST00000514834 MEOX2P50222 304 aa10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-214ENST00000514834 PPT1P50897 306 aa10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-214ENST00000514834 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-214ENST00000514834 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.6 ms