RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CBY3A6NI87 242 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 PMS2P5A8MQ11 134 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 NUDT3O95989 172 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 SRRQ9GZT4 340 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 FLVCR2Q9UPI3 526 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 AZU1P20160 251 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CDKN1BP46527 198 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL18P55774 89 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R30P59541 319 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 FCN2Q15485 313 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf74Q96GX8 76 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TSC22D2O75157 780 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CXCL2P19875 107 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC38A11Q08AI6 406 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF546Q86UE3 836 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 K7EPK0 472 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNKO75909 580 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CLINT1Q14677 625 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 BAK1Q16611 211 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 LCN15Q6UWW0 184 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00305Q7Z4B0 112 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 GGACTQ9BVM4 153 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 L7N2F9 121 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 VAMP2P63027 116 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB31Q13636 194 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PATE2Q6UY27 113 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 H7BYZ3 331 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 AGPAT2O15120 278 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 COX7A2P2O60397 106 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF846Q147U1 533 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 Q6ZRG5 221 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-220ENST00000511663 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 BCAP31P51572 246 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C10orf113Q5VZT2 155 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MITD1Q8WV92 249 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C7orf66A4D0T2 115 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 OR5I1Q13606 314 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C6orf223Q8N319 242 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MBPP02686 304 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF575Q86XF7 245 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 NACAE9PAV3 2078 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM25EA8MYX2 175 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SNURFLB1AK76 121 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMLGP49069 296 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL16Q0P5N6 197 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 GUK1Q16774 197 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 OR1L4Q8NGR5 311 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF141Q8WVD5 230 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MGST2Q99735 147 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RLN2P04090 185 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 CAV2P51636 162 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SSX7Q7RTT5 188 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM37Q8WXS4 190 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C5orf51A6NDU8 294 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf90A8MZG2 172 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 H3BTX0 84 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 IL7P13232 177 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 LEPP41159 167 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TNP2Q05952 138 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 OPCMLQ14982 345 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 NRARPQ7Z6K4 114 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PFDN5Q99471 154 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2-220ENST00000511663 J3KRW8 73 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.7 ms