RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PRELID1Q9Y255 219 aa10.75□□□□□ -0.69
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SH3BP2-208ENST00000504294 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 RCHY1Q96PM5 261 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP2-208ENST00000504294 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 MORN5Q5VZ52 161 aa10.7□□□□□ -0.7
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SH3BP2-208ENST00000504294 OR8A1Q8NGG7 326 aa10.69□□□□□ -0.7
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SH3BP2-208ENST00000504294 BCL2L11O43521 198 aa10.68□□□□□ -0.7
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SH3BP2-208ENST00000504294 PYYP10082 97 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 TPT1P13693 172 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 CNN1P51911 297 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB2AP61019 212 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 TMUB2Q71RG4 321 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 OR11H4Q8NGC9 324 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 STOML3Q8TAV4 291 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00477Q96M19 166 aa10.66□□□□□ -0.7
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