RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 TAS2R60P59551 318 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ID3Q02535 119 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PPP1R1AQ13522 171 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CLINT1Q14677 625 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PSG3Q16557 428 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 C6orf223Q8N319 242 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PSENENQ9NZ42 101 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00869P0C866 280 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 C16orf74Q96GX8 76 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 H3BMQ9 156 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CXCL3P19876 107 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 S100A5P33763 92 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PLP1P60201 277 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 TRIM63Q969Q1 353 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM8Q96KF7 97 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 UHRF2Q96PU4 802 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ARL6Q9H0F7 186 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 A0A087X0K7 114 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 A6NHS1 94 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 H7BYZ3 331 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 GOSR2O14653 212 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ADAP1O75689 374 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CDK2AP2O75956 126 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CDKN1BP46527 198 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 OR5I1Q13606 314 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 TEPPQ6URK8 271 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SSX7Q7RTT5 188 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf170A2RU37 121 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 FNDC10F2Z333 226 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SSSCA1O60232 199 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 INPP1P49441 399 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 DLK1P80370 383 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 RNF141Q8WVD5 230 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 ARV1Q9H2C2 271 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 Q9H8V8 135 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 K7EPK0 472 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CXCL2P19875 107 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 LCN15Q6UWW0 184 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC190Q86UF4 302 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 V9GYH0 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT4-211ENST00000498534 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 M6PRP20645 277 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TAS2R30P59541 319 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TTC32Q5I0X7 151 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 PATE2Q6UY27 113 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF546Q86UE3 836 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF503Q96F45 646 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SNURFLB1AK76 121 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 COX7A2P2O60397 106 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB1D2O95969 90 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 RLN2P04090 185 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 OR4E1P0C645 316 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 C4orf46Q504U0 113 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GGACTQ9BVM4 153 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 HSPG2P98160 4391 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 GAGE12BA1L429 117 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 CCDC160A6NGH7 325 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT4-211ENST00000498534 AGPAT2O15120 278 aa8.37□□□□□ -1.07
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