RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGLL1P15814 213 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRR31Q5SQ13 230 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WNT2P09544 360 aa14.69□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SH2D1AO60880 128 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COX8AP10176 69 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYYR1Q96J86 154 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GAFA1Q96PS6 74 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCR2O95944 276 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRD5A1P18405 259 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDE6HQ13956 83 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SFTA2Q6UW10 78 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MGAMO43451 1857 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGHG3P01860 377 aa14.68□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A0A0G2JNJ9 132 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGHV4-39P01824 125 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM219Q86XT9 240 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 Q9UFV3 132 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLXNA2O75051 1894 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF138P52744 262 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WISP1O95388 367 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WFDC12Q8WWY7 111 aa14.67□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 K7EP34 96 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDKN1BP46527 198 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STPG4Q8N801 248 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 K7EP13 123 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATXN8Q156A1 80 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MLANAQ16655 118 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFNA4P52798 201 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLAQ13239 276 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF114Q8NC26 417 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LINC00479Q96M42 142 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGKV1-16P04430 117 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 Q8NFD4 153 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 Q6ZS92 163 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 F8W1H4 67 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNTFRP26992 372 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.65□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SIVA1O15304 175 aa14.64□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STHQ8IWL8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AMN1Q8IY45 258 aa14.64□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OOSP1A8MZH6 123 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPINK8P0C7L1 97 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HTN3P15516 51 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF524Q96C55 264 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VWC2Q2TAL6 325 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LYPD6Q86Y78 171 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GGTLC3B5MD39 225 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.63□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.62□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.62□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LY6HO94772 140 aa14.62□□□□□ -0.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GTF3C1Q12789 2109 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms