RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 FAM78BQ5VT40 261 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZNX1 250 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 RNF182Q8N6D2 247 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 RNF24Q9Y225 148 aa6.34□□□□□ -1.39
PKP4-216ENST00000495123 SLC17A3O00476 420 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 UBE2CO00762 179 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ARPC5O15511 151 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 PYYP10082 97 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HLA-DRB4P13762 266 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF266Q14584 549 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZWC4 215 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.33□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.33□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SPRY2O43597 315 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 IGKV3-20P01619 116 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SPP1P10451 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 CXCL2P19875 107 aa6.32□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RNF183Q96D59 192 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HRH4Q9H3N8 390 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RPRMQ9NS64 109 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 FUT9Q9Y231 359 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.32□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 A0A0J9YX75 114 aa6.31□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 BLNKQ8WV28 456 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF503Q96F45 646 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.31□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.31□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.31□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 AGRNO00468 2067 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 A8MTW9 85 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 PRAC2D3DTV9 90 aa6.3□□□□□ -1.4
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PKP4-216ENST00000495123 OR10J4P0C629 311 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 M6PRP20645 277 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 GUK1Q16774 197 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 AMTNQ6UX39 209 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 FXYD5Q96DB9 178 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RARRES2Q99969 163 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 PAXXQ9BUH6 204 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR51M1Q9H341 326 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 XCL2Q9UBD3 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 A0A0J9YWU9 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HMSDA8MTL9 139 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 M0R3E3 92 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 OR7C2O60412 319 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 ZNF253O75346 499 aa6.29□□□□□ -1.4
PKP4-216ENST00000495123 RHOBP62745 196 aa6.29□□□□□ -1.4
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