RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493208.1

IRF1-210, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IRF1, Length 1,023 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-210ENST00000493208 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.8□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.8□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.8□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 CCSO14618 274 aa9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 PET100P0DJ07 73 aa9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 BAXQ07812 192 aa9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 UHRF2Q96PU4 802 aa9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 F6UB75 175 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 DAD1P61803 113 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 PSG3Q16557 428 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 C12orf74Q32Q52 190 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 APLNQ9ULZ1 77 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.78□□□□□ -0.84
IRF1-210ENST00000493208 LYRM9A8MSI8 78 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 A8MTW9 85 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CST7O76096 145 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CXCL3P19876 107 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 C20orf173Q96LM9 149 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 DKK2Q9UBU2 259 aa9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 E5RGE8 158 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 UPK1BO75841 260 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CCNKO75909 580 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CDKN1BP46527 198 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CCDC28AQ8IWP9 274 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 RNF182Q8N6D2 247 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 LINC01587Q99440 93 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 MGST2Q99735 147 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CELA1Q9UNI1 258 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.76□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ZNF253O75346 499 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 TAS2R60P59551 318 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 DEFB1P60022 68 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 RAB32Q13637 225 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 VWC2Q2TAL6 325 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 C16orf74Q96GX8 76 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 NMES1Q9C002 83 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.75□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 H7BYZ3 331 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 M0R2Z0 102 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 FGF7P21781 194 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 LEPP41159 167 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 AMTNQ6UX39 209 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PATE2Q6UY27 113 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PRELID1Q9Y255 219 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 AGRNO00468 2067 aa9.74□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 HTN3P15516 51 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PRR20EP86478 221 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PRR20CP86479 221 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PRR20DP86480 221 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PRR20BP86481 221 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PRR20AP86496 221 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ARL16Q0P5N6 197 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 PDE6HQ13956 83 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 BATF3Q9NR55 127 aa9.73□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 SSNA1O43805 119 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 OPCMLQ14982 345 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 MIC13Q5XKP0 118 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ODF3Q96PU9 254 aa9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
IRF1-210ENST00000493208 ATP5G1P05496 136 aa9.71□□□□□ -0.86
IRF1-210ENST00000493208 IGLC2P0DOY2 106 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms