RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 PET100P0DJ07 73 aa13.78□□□□□ -0.2
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NISCH-209ENST00000485765 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-209ENST00000485765 CXCL2P19875 107 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-209ENST00000485765 CXCL3P19876 107 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-209ENST00000485765 PSG9Q00887 426 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-209ENST00000485765 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-209ENST00000485765 RNF182Q8N6D2 247 aa13.78□□□□□ -0.2
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NISCH-209ENST00000485765 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.75□□□□□ -0.21
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NISCH-209ENST00000485765 FCN2Q15485 313 aa13.74□□□□□ -0.21
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NISCH-209ENST00000485765 C1orf158Q8N1D5 194 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-209ENST00000485765 ZNF253O75346 499 aa13.71□□□□□ -0.21
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NISCH-209ENST00000485765 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.7□□□□□ -0.22
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NISCH-209ENST00000485765 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.69□□□□□ -0.22
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NISCH-209ENST00000485765 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 SMIM3Q9BZL3 60 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 TMEM189A5PLL7 270 aa13.67□□□□□ -0.22
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NISCH-209ENST00000485765 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 RFNGQ9Y644 331 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-209ENST00000485765 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa13.66□□□□□ -0.22
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