RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYNJ2BPP57105 145 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRCDQ00LT1 54 aa3.05□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 BSXQ3C1V8 233 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 NECAP1Q8NC96 275 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR146Q96CH1 333 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 USMG5Q96IX5 58 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 C9orf85Q96MD7 179 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 C12orf57Q99622 126 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPIN2AQ99865 258 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51M1Q9H341 326 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0G2JLM5 398 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00587B1AMM8 73 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PLA2G10O15496 165 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 UPK1BO75841 260 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3-48P01763 117 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 FABP1P07148 127 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR13C7P0DN81 318 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCR6P51684 374 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFITM3Q01628 133 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 NMSQ5H8A3 153 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLLU1Q5K131 121 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNLZQ5SXM8 178 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF429Q86V71 674 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8N402 240 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC35G3Q8N808 338 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR1L8Q8NGR8 309 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5B3Q8NH48 314 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.04□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 WFDC10AQ9H1F0 79 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 NAA60Q9H7X0 242 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 NUDT15Q9NV35 164 aa3.04□□□□□ -1.92
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TRAPPC10-211ENST00000485621 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.04□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 C2orf70A6NJV1 201 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 DISC1C4P0D8 188 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LGALS9O00182 355 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TGOLN2O43493 480 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PITX3O75364 302 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFNA6P05013 189 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTSGP08311 255 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 C8orf88P0DMB2 117 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 IL7P13232 177 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 INSL3P51460 131 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFA1P59665 94 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEFA3P59666 94 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATP5G2Q06055 141 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1R1AQ13522 171 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPEL1Q2QD12 228 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PYDC2Q56P42 97 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPHB5Q86YW7 130 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR1P1Q8NH06 330 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM56Q96MV1 263 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRRT1Q99946 306 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 B9D2Q9BPU9 175 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 HINT2Q9BX68 163 aa3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
TRAPPC10-211ENST00000485621 BIN3Q9NQY0 253 aa3.03□□□□□ -1.92
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