RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 ZNF738Q8NE65 137 aa15.14■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 CLUHP3Q96NS8 147 aa15.14■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 XCL2Q9UBD3 114 aa15.14■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.13■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 SMIM3Q9BZL3 60 aa15.13■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 TRAV5A0A0B4J249 113 aa15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 FXYD7P58549 80 aa15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.12■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 IGLC2P0DOY2 106 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 HLA-DMBP28068 263 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 PSG9Q00887 426 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 PMS2P11Q13670 270 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 OXA1LQ15070 435 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 HRH4Q9H3N8 390 aa15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 CXorf65A6NEN9 183 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 IFNA5P01569 189 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 MIFP14174 115 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 CNN1P51911 297 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 PSG3Q16557 428 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 Q8NAQ8 132 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 ASB13Q8WXK3 278 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 MFFQ9GZY8 342 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 X6R8D5 127 aa15.1■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 LYSTQ99698 3801 aa15.09■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 H3BTX0 84 aa15.09■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 SLC17A3O00476 420 aa15.09■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 DEFB4AO15263 64 aa15.09■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 GIPP09681 153 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 GUK1Q16774 197 aa15.09■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.08■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 A8MTW9 85 aa15.08■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 H3BQ15 152 aa15.08■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 SCGB1C1Q8TD33 95 aa15.08■□□□□ 0.01
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 AMTNQ6UX39 209 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 OR8A1Q8NGG7 326 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 TMEM14CQ9P0S9 112 aa15.07■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 ZNF586Q9NXT0 402 aa15.06■□□□□ 0
NELFE-208ENST00000481121 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 NUPR2A6NF83 97 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 RBMY1CP0DJD4 496 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 PYYP10082 97 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 MIR17HGQ75NE6 70 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 AQP10Q96PS8 301 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 SLC25A2Q9BXI2 301 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 WFDC1Q9HC57 220 aa15.05■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 ZNF253O75346 499 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 AMBPP02760 352 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 RHOBP62745 196 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 SPINK13Q1W4C9 94 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.04■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 TRBV19A0A075B6N1 114 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 M0R2Z0 102 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 FUT9Q9Y231 359 aa15.03■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 ZNF266Q14584 549 aa15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 Q5BKY6 102 aa15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 NEU1Q99519 415 aa15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.02■□□□□ -0
NELFE-208ENST00000481121 INSP01308 110 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 PDE6HQ13956 83 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 BLNKQ8WV28 456 aa15.02□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 RYR3Q15413 4870 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 OR51M1Q9H341 326 aa15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NELFE-208ENST00000481121 SMIM9A6NGZ8 99 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms