RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476594.1

CCM2-208, Transcript of CCM2 scaffold protein, human

TSL 3

Gene CCM2, Length 533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCM2-208	ENST00000476594	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594		X6R8D5	127 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	RYR2	Q92736	4967 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	INS	P01308	110 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	FGF7	P21781	194 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	IL15RA	Q13261	267 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	GUK1	Q16774	197 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	VWC2	Q2TAL6	325 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF709	Q8N972	641 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CCM2-208	ENST00000476594	IGSF23	A1L1A6	192 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594		F6UB75	175 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	CXCL3	P19876	107 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	HLA-DMB	P28068	263 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	FXYD7	P58549	80 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RHOB	P62745	196 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	OPCML	Q14982	345 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PSG3	Q16557	428 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RRN3P1	Q2M238	152 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PATE2	Q6UY27	113 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594		A8MTW9	85 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	DEFB1	P60022	68 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RNF182	Q8N6D2	247 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	IGLL5	B9A064	214 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF253	O75346	499 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	SIX6	O95475	246 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	TSPO	P30536	169 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	EMP1	P54849	157 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	IFITM3	Q01628	133 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594		Q6ZTC4	211 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PTTG1	O95997	202 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	IFNA5	P01569	189 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	CDKN1B	P46527	198 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PDE6H	Q13956	83 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	RNF126	Q9BV68	326 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	PRELID1	Q9Y255	219 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594		M0R2Z0	102 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	MPC2	O95563	127 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	IGLC2	P0DOY2	106 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	NHLH2	Q02577	135 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	CLINT1	Q14677	625 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	OXA1L	Q15070	435 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	AMTN	Q6UX39	209 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	THAP6	Q8TBB0	222 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	FAM210B	Q96KR6	192 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	C17orf77	Q96MU5	243 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	ATP5S	Q99766	215 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CCM2-208	ENST00000476594	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23

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