RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466635.1

SYP-203, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-203ENST00000466635 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.02□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 LINC00052Q96N35 136 aa10.02□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 PAXXQ9BUH6 204 aa10.02□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 RPRMQ9NS64 109 aa10.02□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.02□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 UMAD1C9J7I0 102 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 H3BQ15 152 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 SOCS3O14543 225 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 PYYP10082 97 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 RNF141Q8WVD5 230 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 RAB24Q969Q5 203 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 SLC50A1Q9BRV3 221 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 SRD5A3Q9H8P0 318 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.01□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 A8MZ25 164 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 NBEAP1P0C6P0 100 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 PDE6HQ13956 83 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 APRG1Q8IVJ8 170 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 C17orf77Q96MU5 243 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ZNF586Q9NXT0 402 aa10□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 H3BTX0 84 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ZNF253O75346 499 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 OR10J4P0C629 311 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 PSG9Q00887 426 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 BLNKQ8WV28 456 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 TMED6Q8WW62 240 aa9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 SORL1Q92673 2214 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 CXorf1O96002 111 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 STAG3L2P0CL84 134 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 STAG3L3P0CL85 134 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 RAB5CP51148 216 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 PSG3Q16557 428 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 STHQ8IWL8 128 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ZNF738Q8NE65 137 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 FXYD5Q96DB9 178 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.98□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ZNF124Q15973 351 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 RNF182Q8N6D2 247 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 ZNF503Q96F45 646 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 CITED4Q96RK1 184 aa9.97□□□□□ -0.81
SYP-203ENST00000466635 KNCNA6PVL3 124 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 SLC17A3O00476 420 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 ZNF726P1Q15940 193 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 C20orf173Q96LM9 149 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 PRELID1Q9Y255 219 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.96□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 NDUFB4O95168 129 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 GCHFRP30047 84 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 APOC4P55056 127 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 RANP62826 216 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.95□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 HLA-DRB4P13762 266 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 HLA-DMBP28068 263 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 FHITP49789 147 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 SULT1A2P50226 295 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 ICAM4Q14773 271 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 FAM74A1Q5RGS3 127 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 SSX7Q7RTT5 188 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.94□□□□□ -0.82
SYP-203ENST00000466635 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.94□□□□□ -0.82
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