RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464362.5

HPS4-208, Transcript of HPS4, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene HPS4, Length 4,277 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4-208ENST00000464362 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ZNF56Q15929 161 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ZNF329Q86UD4 541 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 RAXQ9Y2V3 346 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 JMJD8Q96S16 334 aa7.33□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 K7EM74 188 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 C15orf32Q32M92 178 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 E7EQL1 145 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 Q6ZS92 163 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 STPG4Q8N801 248 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 HBDP02042 147 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 MORN5Q5VZ52 161 aa7.32□□□□□ -1.24
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HPS4-208ENST00000464362 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 C5orf30Q96GV9 206 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SIGMAR1Q99720 223 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 TMEM213A2RRL7 107 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 CFHR2P36980 270 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 MUC3AQ02505 3323 aa7.32□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SMIM13P0DJ93 91 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 GUSBP1Q15486 140 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 TNFRSF14Q92956 283 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 GAGE1Q13065 139 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 UTF1Q5T230 341 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 TRGV9Q99603 122 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 CITED1Q99966 193 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.31□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 IGLV2-14P01704 120 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ID1P41134 155 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 LTBP2Q14767 1821 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 PSMB11A5LHX3 300 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 TMEM238C9JI98 176 aa7.3□□□□□ -1.24
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HPS4-208ENST00000464362 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 IGLL1P15814 213 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 Q0VG73 95 aa7.3□□□□□ -1.24
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HPS4-208ENST00000464362 VWC2Q2TAL6 325 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 Q6ZSR3 168 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 Q8TCH9 128 aa7.3□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.29□□□□□ -1.24
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HPS4-208ENST00000464362 IGLC3P0DOY3 106 aa7.29□□□□□ -1.24
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HPS4-208ENST00000464362 PRR20CP86479 221 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 PRR20DP86480 221 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 PRR20BP86481 221 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 PRR20AP86496 221 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ERCC8Q13216 396 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 MSMPQ1L6U9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 Q6AWC8 147 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 C17orf77Q96MU5 243 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 KIR2DL4Q99706 377 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 Q86TA4 180 aa7.29□□□□□ -1.24
HPS4-208ENST00000464362 VCANP13611 3396 aa7.29□□□□□ -1.24
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