RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 A0A0J9YX75 114 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 SIX6O95475 246 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 TAS2R45P59539 299 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
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DDX39B-216ENST00000462421 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 MGST2Q99735 147 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 MED28Q9H204 178 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-216ENST00000462421 IGSF23A1L1A6 192 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 IGLL5B9A064 214 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 F6UB75 175 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 SOCS3O14543 225 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 LEPP41159 167 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 CSN1S1P47710 185 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PSG3Q16557 428 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 MIC13Q5XKP0 118 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 RNF182Q8N6D2 247 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 LINC01587Q99440 93 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 NEU1Q99519 415 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ATP5SQ99766 215 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PRELID1Q9Y255 219 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 HTN1P15515 57 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 HLA-DMBP28068 263 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 DAD1P61803 113 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ARL16Q0P5N6 197 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF266Q14584 549 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 OPCMLQ14982 345 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 VWC2Q2TAL6 325 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 Q8NAQ8 132 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 BLNKQ8WV28 456 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 A0A1W2PPV4 95 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 M0R2Z0 102 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 OR7C2O60412 319 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 CXCL3P19876 107 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 CDKN1BP46527 198 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PDE6HQ13956 83 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 OXA1LQ15070 435 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 KHDC3LQ587J8 217 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ASB13Q8WXK3 278 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 SNURFLB1AK76 121 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF253O75346 499 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 MPC2O95563 127 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 HTN3P15516 51 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PRR20EP86478 221 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PRR20CP86479 221 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PRR20DP86480 221 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PRR20BP86481 221 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PRR20AP86496 221 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 NHLH2Q02577 135 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 RGS21Q2M5E4 152 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 C16orf74Q96GX8 76 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 C20orf173Q96LM9 149 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 PAXXQ9BUH6 204 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 MBD2Q9UBB5 411 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 HSPB11Q9Y547 144 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-216ENST00000462421 X6R8D5 127 aa6.49□□□□□ -1.37
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