RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-230ENST00000462130 STHQ8IWL8 128 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 ARV1Q9H2C2 271 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 IGLL5B9A064 214 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 G3V3Q6 166 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 COX7A2P2O60397 106 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 IFNA5P01569 189 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 OPCMLQ14982 345 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 MORN5Q5VZ52 161 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 ASB13Q8WXK3 278 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 C17orf77Q96MU5 243 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 ATP5SQ99766 215 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 C11orf94C9JXX5 98 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 MPDU1O75352 247 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF688P0C7X2 276 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 B2MP61769 119 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF709Q8N972 641 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 DCANP1Q8TF63 244 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00052Q96N35 136 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 AQP10Q96PS8 301 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 NRN1Q9NPD7 142 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 A0A1B0GVG6 124 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 H3BRN7 92 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 ARPC5O15511 151 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 S100A7P31151 101 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 GALR1P47211 349 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 APLNQ9ULZ1 77 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 RNF222A6NCQ9 220 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 KNCNA6PVL3 124 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 H3BTX0 84 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 DEFB1P60022 68 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 PSMG4Q5JS54 123 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 C16orf92Q96LL3 132 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 HRH4Q9H3N8 390 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 HERC2O95714 4834 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 SPP1P10451 314 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 MIFP14174 115 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 HLA-DMBP28068 263 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 ID1P41134 155 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 FAM78BQ5VT40 261 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 S100A7AQ86SG5 101 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 Q8NAQ8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 C20orf173Q96LM9 149 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 GPR82Q96P67 336 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 PFDN5Q99471 154 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 H3BQ15 152 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 SOCS3O14543 225 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 Q6ZTC4 211 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-230ENST00000462130 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.29□□□□□ -1.24
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