RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		A8MTW9	85 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RGS10	O43665	173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SCGN	O76038	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TOMM40	O96008	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PMP2	P02689	132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB4A	P20338	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	EVI2A	P22794	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RFX2	P48378	723 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TAS2R20	P59543	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPAN5	P62079	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	GAMT	Q14353	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		Q8N814	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A0B4J293	547 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RS1	O15537	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	FABP1	P07148	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A4	P12235	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMB9	P28065	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	S100G	P29377	79 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	AKR1C2	P52895	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	FGL1	Q08830	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	NXPH3	O95157	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	CRYGD	P07320	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LYZ	P61626	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZSA8	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		Q6ZTI0	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		H7BYZ3	331 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	GALR1	P47211	349 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SPCS3	P61009	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	NCS1	P62166	190 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF90	Q03938	601 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR2F1	Q13607	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	MGLL	Q99685	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504		Q9HAA7	133 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
HDLBP-222	ENST00000449504	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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