RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 AGRNO00468 2067 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 A8MTW9 85 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 C4BPBP20851 252 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 DEFB1P60022 68 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 PSG3Q16557 428 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 GCSAMLQ5JQS6 135 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM78BQ5VT40 261 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 IL17DQ8TAD2 202 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 RARRES2Q99969 163 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BQ15 152 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF253O75346 499 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF266Q14584 549 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 IGFL4Q6B9Z1 124 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 OR11H2Q8NH07 326 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TIMM9Q9Y5J7 89 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 F6UB75 175 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 PSG9Q00887 426 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF182Q8N6D2 247 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF738Q8NE65 137 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFSF18Q9UNG2 199 aa12.28□□□□□ -0.44
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 G3V3Q6 166 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FFAR4Q5NUL3 377 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FUT9Q9Y231 359 aa12.27□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF222A6NCQ9 220 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 IGKV3-20P01619 116 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-DMBP28068 263 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE6HQ13956 83 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8A1Q8NGG7 326 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 XCL2Q9UBD3 114 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0J9YWU9 116 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CNN1P51911 297 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 AMTNQ6UX39 209 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51M1Q9H341 326 aa12.25□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 H3BTX0 84 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC17A3O00476 420 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 AMBPP02760 352 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MIFP14174 115 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 M6PRP20645 277 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 RHOBP62745 196 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CASC10Q5T4H9 136 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35B3Q9H1N7 401 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 X6R8D5 127 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFB4O95168 129 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NBEAP1P0C6P0 100 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PYYP10082 97 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TAS2R45P59539 299 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SERF2P84101 59 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 NEU1Q99519 415 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PAXXQ9BUH6 204 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MFFQ9GZY8 342 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 PRELID1Q9Y255 219 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 TAAR5O14804 337 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6V0CP27449 155 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 Q8NAQ8 132 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF141Q8WVD5 230 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FXYD5Q96DB9 178 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 RFNGQ9Y644 331 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 MBP02144 154 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 FXYD7P58549 80 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPV4 95 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 HMSDA8MTL9 139 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 ARPC5O15511 151 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 KHDC3LQ587J8 217 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZNX1 250 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10G4Q8NGN3 311 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10G9Q8NGN4 311 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10G7Q8NGN6 311 aa12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms