RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439875.1

FAM225B-202, Transcript of family with sequence similarity 225 member B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM225B, Length 7,380 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM225B-202ENST00000439875 DKK1O94907 266 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 IGHV4-39P01824 125 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 GFI1Q99684 422 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 A0A087X0M5 115 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 A0A1B0GX30 115 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 ATOH7Q8N100 152 aa8.48□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 FABP2P12104 132 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 KNCNA6PVL3 124 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 PAX9P55771 341 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 TTC32Q5I0X7 151 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 PPBPP02775 128 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 Q5BKY6 102 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 ID3Q02535 119 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.47□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.46□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.46□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.46□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
FAM225B-202ENST00000439875 GP9P14770 177 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LAGE3Q14657 143 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 A0A087WWL8 130 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 NMBP08949 121 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 DEFB136Q30KP8 78 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 PRO3102Q9H379 93 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 JPT2Q9H910 190 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 IMMP2LQ96T52 175 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.46□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 H3BUA1 57 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 A0A0U1RRA0 63 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 GAGE10A6NGK3 116 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00587B1AMM8 73 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LHBP01229 141 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 RNF144BQ7Z419 303 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 DKK4Q9UBT3 224 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 GAGE12JA6NER3 117 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 IGKV1-5P01602 117 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 GAGE1Q13065 139 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 GAGE4Q13068 117 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 GAGE5Q13069 117 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 GAGE13Q4V321 117 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 NMSQ5H8A3 153 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 WDR86Q86TI4 376 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00311Q8N616 119 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 C1orf159Q96HA4 380 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 RNF126Q9BV68 326 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 VWC2Q2TAL6 325 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.45□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 VCYO14598 125 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 FOXE3Q13461 319 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 OSTCQ9NRP0 149 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 SMIM13P0DJ93 91 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 NTF4P34130 210 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 C22orf46C9J442 243 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 MLANAQ16655 118 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 CSTL1Q9H114 145 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LINC01549A6NIU2 74 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 RASL10AQ92737 203 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 CADP27708 2225 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 SLURP1P55000 103 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.43□□□□□ -1.06
FAM225B-202ENST00000439875 A0A096LPF7 62 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms