RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 S100A7P31151 101 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 IL15RAQ13261 267 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 BAP18Q8IXM2 172 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 NEU1Q99519 415 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 GGACTQ9BVM4 153 aa9.91□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 A8MTW9 85 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 SLC17A3O00476 420 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 CAMLGP49069 296 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 OPCMLQ14982 345 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 RFNGQ9Y644 331 aa9.9□□□□□ -0.82
PRAME-209ENST00000439106 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 SULT1A1P50225 295 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 BAXQ07812 192 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 NACAE9PAV3 2078 aa9.89□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 HBE1P02100 147 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PSG3Q16557 428 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 DKK2Q9UBU2 259 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 INSP01308 110 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 RHOBP62745 196 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 RRN3P1Q2M238 152 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 VWC2Q2TAL6 325 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 STX12Q86Y82 276 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.87□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 TMEM189A5PLL7 270 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PRAC2D3DTV9 90 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 H3BQ15 152 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 AMBPP02760 352 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 HTN3P15516 51 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 FGF7P21781 194 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 TCTAP57738 103 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 B2MP61769 119 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 NHLH2Q02577 135 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 LCN15Q6UWW0 184 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 S100A7AQ86SG5 101 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 THAP6Q8TBB0 222 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 RNF126Q9BV68 326 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.86□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 DNAH2Q9P225 4427 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 H0YIZ8 118 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 IGLC2P0DOY2 106 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 AZU1P20160 251 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 S100A11P31949 105 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 RAB31Q13636 194 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 KIR3DS1Q14943 382 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZRG5 221 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 CXCL2P19875 107 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 HBG1P69891 147 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 HBG2P69892 147 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-209ENST00000439106 J3KRW8 73 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 PYYP10082 97 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 HTN1P15515 57 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 H2BFSP57053 126 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 DEFA1P59665 94 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 DEFA3P59666 94 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 CLINT1Q14677 625 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 FCN2Q15485 313 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-209ENST00000439106 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms