RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 M0R296 226 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AMN1Q8IY45 258 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AP1S3Q96PC3 154 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRYGBP07316 175 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 COX7A1P24310 79 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CACNG7P62955 275 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DEFB123Q8N688 67 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-212ENST00000433317 I3L2K1 104 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PSG3Q16557 428 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAB37Q96AX2 223 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 THYN1Q9P016 225 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 K7EM74 188 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 K7EQM0 130 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 K7ERU9 68 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FTH1P19P0C7X4 201 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FGF6P10767 208 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MEGF9Q9H1U4 602 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CACNA1HO95180 2353 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H3BUT2 72 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CNIH1O95406 144 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGFBPL1Q8WX77 278 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRELID3AQ96N28 172 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 JMJD8Q96S16 334 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SMKR1H3BMG3 65 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IL4P05112 153 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SEC11AP67812 179 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBPJQ06330 500 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CT45A10P0DMU9 189 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RIPPLY3P57055 190 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C16orf97H3BN30 126 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NMUP48645 174 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CUL9Q8IWT3 2517 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H3BRN7 92 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LYNX1P0DP58 116 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIR3DS1Q14943 382 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TM4SF20Q53R12 229 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM189A5PLL7 270 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 K7EIM0 57 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 THBDP07204 575 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ORMDL3Q8N138 153 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNF125Q96EQ8 232 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.36□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A0G2JNJ9 132 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A1B0GW15 77 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A6NDN8 102 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PCP2Q8IVA1 136 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GATD1Q8NB37 220 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RPEQ96AT9 228 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q9UFV3 132 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A1L4Q6 167 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C9orf118A6NHY6 69 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SH2D1AO60880 128 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CEACAM4O75871 244 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGLV1-47P01700 117 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CSTL1Q9H114 145 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C18orf15Q96N68 181 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q6AWC8 147 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATMQ13315 3056 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-212ENST00000433317 A0A0G2JLM5 398 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms