RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 C9JCJ5 164 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CLDN34H7C241 214 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PEX7O00628 323 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PPP1R2P9O14990 202 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 IGHG4P01861 327 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ELANEP08246 267 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 GNG4P50150 75 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00310P59036 64 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 TAS2R60P59551 318 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 RAB4BP61018 213 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PDE6HQ13956 83 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 LYPD1Q8N2G4 141 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 GPR82Q96P67 336 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 METTL26Q96S19 204 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF702PQ9H963 129 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM160Q9NX00 188 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 EPDR1Q9UM22 224 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.13□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ACANP16112 2415 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 MTORP42345 2549 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PPP5D1E7EU14 171 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 H3BTX0 84 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 H7BYZ3 331 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFA4O00483 81 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3-11P01762 117 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 MED14OSP0DP75 135 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CD99P14209 185 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 MYCNOSP40205 109 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 GALR1P47211 349 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 UBE2G1P62253 170 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PSG9Q00887 426 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 FOXE3Q13461 319 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 RNF212Q495C1 297 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 TEX38Q6PEX7 206 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 LINC01551Q86U37 167 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 Q8N2B8 174 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 C2CD4CQ8TF44 421 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 OR5B12Q96R08 314 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 DERL1Q9BUN8 251 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 KLK15Q9H2R5 256 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 Q9H3A6 140 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.12□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 AKAP9Q99996 3911 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF785A8K8V0 405 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 K7EQM0 130 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CRYBA1P05813 215 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 IGLC2P0DOY2 106 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 RAB4AP20338 218 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 S100PP25815 95 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 PSMB8P28062 276 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CSN1S1P47710 185 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 MEOX2P50222 304 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CENPWQ5EE01 88 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 OCC1Q8TAD7 63 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ISOC2Q96AB3 205 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 FMC1Q96HJ9 113 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 DUX5Q96PT3 197 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ATG101Q9BSB4 218 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 TNCP24821 2201 aa5.11□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 A0A087X0K7 114 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PS18 150 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF320A2RRD8 509 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 COLCA2A8K830 154 aa5.1□□□□□ -1.59
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms