RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF345Q14585 488 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.26□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KNCNA6PVL3 124 aa11.25□□□□□ -0.61
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARPC5O15511 151 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFFQ9GZY8 342 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FUT9Q9Y231 359 aa11.25□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SORL1Q92673 2214 aa11.25□□□□□ -0.61
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JTBO76095 146 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M6PRP20645 277 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R45P59539 299 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHOBP62745 196 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERF2P84101 59 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE6HQ13956 83 aa11.24□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBP02144 154 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF183Q96D59 192 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.23□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0D9SG52 128 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0J9YX75 114 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BQ15 152 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMLR1H3BR10 107 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRY2O43597 315 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V0CP27449 155 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSG3Q16557 428 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C20orf173Q96LM9 149 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.22□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSG9Q00887 426 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KHDC3LQ587J8 217 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF738Q8NE65 137 aa11.21□□□□□ -0.61
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR51M1Q9H341 326 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.21□□□□□ -0.61
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPV4 95 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A8MTW9 85 aa11.2□□□□□ -0.62
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF182Q8N6D2 247 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.2□□□□□ -0.62
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RETNQ9HD89 108 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRELID1Q9Y255 219 aa11.2□□□□□ -0.62
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDF5OSQ5U4N7 250 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF141Q8WVD5 230 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 F6UB75 175 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMBPP02760 352 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB2AP61019 212 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKAP14Q86UN6 197 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FXYD5Q96DB9 178 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BTX0 84 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCL2L11O43521 198 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFB4O95168 129 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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